复杂网络分析的数据输入问题：以Pajek的.net格式为例

snachina

关于网络分析软件Pajek的数据输入问题

要做网络分析，首先就要有一个可供分析的网络。许多人碰到的第一个困难就是，手头有点数据，想要做分析，但是不知道怎么把数据变成网络文件。在这里谈一点个人的建议。

1）明确什么是点，什么是线。
最常见的列表形式是分成两列。设想第一列表示的是连线的一端，第二列表示的是连线的另一端。如果关系是有方向性的，那么这样的表达方式就意味着从第一列点指向第二列的点的箭头。

AAA

[/td][td]

AAA

[/td][td]

AAA

[/td][td]

BBB

[/td][td]

BBB

[/td][td]

CCC

[/td][td]

CCC

[/td][td]

CCC

[/td][td]

UUU

[/td][td]

WWW

[/td][td]

如果情况复杂一点，涉及到连线的强度，那么列出来的表格就可能有三列，多出来的第三列，表示的就是第一列和第二列为端点的连线的强度值。

AAA

[/td][td]

1.9

[/td][/tr]
[tr][td]

YYY

[/td][td]

AAA

[/td][td]

1.3

[/td][/tr]
[tr][td]

UUU

[/td][td]

BBB

[/td][td]

3.6

[/td][/tr]
[tr][td]

WWW

[/td][td]

CCC

[/td][td]

1.1

[/td][/tr]
[tr][td]

BBB

[/td][td]

UUU

[/td][td]

4.2

[/td][/tr]
[tr][td]

AAA

[/td][td]

这一步往往让人不知所措，网络文件格式众多，这里先介绍Pajek常用的.net格式。

Pajek的官网上提供了两个程序：Excell2Pajek和TXT2Pajek。分别可以把Excell格式和TXT格式的数据转换成Pajek的.net格式。虽然方便，但各自有弊端。
Txt2Pajek对中文的支持不佳，但是可以识别第三列的连线强度值。
除了以上两个程序以外，还有一个叫做NodeXL的工具。这是一个EXCELL插件，安装后可以像EXCELL的其他图表绘制程序那样对EXCELL文件进行绘图，只不过是专门绘制网络图。它可以适用于Office2007的.xlsx格式，但是同样对中文的支持差，用它转换成的.net文件，如果含有中文，往往都显示是问号。
如果网络不是很大，那么直接用手工编制即可。以下括号中的内容是作为注意点，而不正式出现在文件中。
1 "AAA"（一定要用半角英文括号，这里表示1号顶点“AAA”。顶点序号后一定要空格）
3 "CCC"
5 "WWW"
7 "YYY"
9 "VVV"
*Arcs（表示以下定义的是弧，如果是无方向的连线，则用*Edges）
1 7 2.1
2 4 0.4
*Edges
3 4 1.1
4 10 4.2
（如果是）
需要注意的是，每一行都需要靠左，前面不允许有空格，而字符之间的隔断，必须是用空格键分开，而不能用制表符Tab键来隔断。有些朋友喜欢在EXCELL中先编辑好了复制黏贴到文本文件中，但是黏贴的时候，列与列之间Tab键隔断，就会导致Pajek不识别这个文件。
我有一阵子总是要编辑各种数据，不胜其烦，于是写了一小段Matlab代码。供参考。
function [vertices,arcs] =makeNet(A,W)
%注意需要按照顺序排列输入。
%vertices把所有的顶点编号按序排列
n=length(A);
arcs(:,3)=W;
    h=length(vertices);
    end;
for b=1:n
  end;
  for c=1:length(vertices)
              arcs(d,1)=c;
              arcs(d,2)=c;
      end;
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用以上代码处理过之后，直接按照手工编制法的介绍，制作网络文件，从而免去手工输入的麻烦。

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